RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 EGLN2Q96KS0 407 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MUC13Q9H3R2 512 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZFP57Q9NU63 452 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 A0A087X0M5 115 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 A0A1B0GX30 115 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 KCNN4O15554 427 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 HCRTR2O43614 444 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MARK3P27448 753 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MAPK4P31152 587 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R40P59535 323 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CLEC17AQ6ZS10 378 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TEX19Q8NA77 164 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 OR8K5Q8NH50 307 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF69Q9UC07 566 aa6.56□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CAPN9O14815 690 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNHIT1O43257 154 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 WDR1O75083 606 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 LAMP2P13473 410 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 UGT1A1P22309 533 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RUNX1T1Q06455 604 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 HYAL1Q12794 435 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ADIPOQQ15848 244 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 NGEFQ8N5V2 710 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 THAP6Q8TBB0 222 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 SGCDQ92629 289 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF583Q96ND8 569 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 A0A0B4J293 547 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PS18 150 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ARL3P36405 182 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZBED6P86452 979 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MYLK3Q32MK0 819 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 FAM171BQ6P995 826 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 KLHL35Q6PF15 583 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 MMP28Q9H239 520 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 SETD4Q9NVD3 440 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.54□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 PI4KAP2A4QPH2 592 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 DCAF7P61962 342 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 LCN10Q6JVE6 187 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 ZNF852Q6ZMS4 543 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 RASGEF1CQ8N431 466 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 WDTC1Q8N5D0 677 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 OR52I2Q8NH67 350 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 USP6NLQ92738 828 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 CMTM3Q96MX0 182 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.53□□□□□ -1.36
SGCE-210ENST00000472326 A0A1W2PP11 408 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TMEM178BH3BS89 294 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 P2RY10O00398 339 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 LINC01565O15544 149 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PLPP2O43688 288 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 FAM106CPP0CH98 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 PLIN5Q00G26 463 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 MAMLD1Q13495 774 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.52□□□□□ -1.37
SGCE-210ENST00000472326 TMEM198Q66K66 360 aa6.52□□□□□ -1.37
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