RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468915.5

SLC13A3-209, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 1,597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-209ENST00000468915 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ANKRD7Q92527 254 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 GLYATL1Q969I3 302 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 BOCQ9BWV1 1114 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 OR1A2Q9Y585 309 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 A0A1W2PR77 199 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 INPP4BO15327 924 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 OR1I1O60431 355 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ERLIN1O75477 346 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM155BO75949 473 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 AHSGP02765 367 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FUCA1P04066 466 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 WNT1P04628 370 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ITGALP20701 1170 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ACRV1P26436 265 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 STX2P32856 288 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR1P46091 355 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CDK3Q00526 305 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ITGA9Q13797 1035 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HEATR4Q86WZ0 1026 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 LPGAT1Q92604 370 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC6A18Q96N87 628 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CAAP1Q9H8G2 361 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 EURLQ9NYK6 297 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 VPS18Q9P253 973 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HMX2A2RU54 273 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 MAP3K13O43283 966 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 MTX2O75431 263 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HAUS5O94927 633 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CNR2P34972 360 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 NUDT1P36639 197 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ABCG1P45844 678 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 TCF15Q12870 199 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CNSTQ6PJW8 725 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 GALNT7Q86SF2 657 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PRSS33Q8NF86 280 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SERAC1Q96JX3 654 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 APOOQ9BUR5 198 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 MED16Q9Y2X0 877 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PI4KAP42356 2102 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CACNA1EQ15878 2313 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ITPKAP23677 461 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 AKT2P31751 481 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PHBP35232 272 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 LAYNQ6UX15 382 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 TAS2R42Q7RTR8 314 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PPM1NQ8N819 430 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SLC44A1Q8WWI5 657 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 SNX19Q92543 992 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 FOXJ1Q92949 421 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 HIC2Q96JB3 615 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 BIRC8Q96P09 236 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CYTH2Q99418 400 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 P2RY12Q9H244 342 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ZNF446Q9NWS9 450 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 ZFATQ9P243 1243 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-209ENST00000468915 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.71□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 TMEM202A6NGA9 273 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 FPGTO14772 594 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 POLD2P49005 469 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 XKR5Q6UX68 686 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-209ENST00000468915 PACS1Q6VY07 963 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms