RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PTER	Q96BW5	349 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR21	Q99679	349 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CEP44	Q9C0F1	390 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS51	Q9UID3	782 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TBX21	Q9UL17	535 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		11.43	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758		A6NHS1	94 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	BTN3A1	O00481	513 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CFLAR	O15519	480 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ADAM12	O43184	909 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPAN3	O60637	253 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CDK14	O94921	469 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	OTC	P00480	354 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PRL	P01236	227 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CKM	P06732	381 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CLTB	P09497	229 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FCGR1A	P12314	374 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPK9	P45984	424 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TLE2	Q04725	743 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAF2	Q12933	501 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LRP8	Q14114	963 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SEMA3A	Q14563	771 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	IHH	Q14623	411 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	OR4D1	Q15615	310 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	USP45	Q70EL2	814 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PIM3	Q86V86	326 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM199	Q8N511	208 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	EXT2	Q93063	718 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A0J9YYE9	177 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN8	A6NHC0	703 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	VGLL3	A8MV65	326 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	QSOX1	O00391	747 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	GFRA2	O00451	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	ECI2	O75521	394 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR47	O94967	919 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	TRBC1	P01850	177 aa		11.41	□□□□□ -0.58
TTLL3-222	ENST00000459758	C8B	P07358	591 aa		11.41	□□□□□ -0.58

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