RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 PIP5K1BO14986 540 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 MLYCDO95822 493 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TTPAP49638 278 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ARPP19P56211 112 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 KIF19Q2TAC6 998 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PNPLA1Q8N8W4 532 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ANKFN1Q8N957 763 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 OR2T34Q8NGX1 318 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 OR2T3Q8NH03 318 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLCO4A1Q96BD0 722 aa23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 H7C0S8 307 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GJB3O75712 270 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CLPTM1O96005 669 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FGBP02675 491 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BMP2P12643 396 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC11A1P49279 550 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 DUSP4Q13115 394 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PTPRCAPQ14761 206 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PACRGLQ8N7B6 248 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 NAT14Q8WUY8 206 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 MAP10Q9P2G4 905 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 DYTNA2CJ06 578 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ATP6AP2O75787 350 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PRLP01236 227 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HDCP19113 662 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TUFMP49411 452 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A2P52569 658 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 OR7D4Q8NG98 312 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 OR4K2Q8NGD2 314 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 OR9I1Q8NGQ6 314 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ADGRE3Q9BY15 652 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SCUBE2Q9NQ36 999 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 C8orf4Q9NR00 106 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 LZTS1Q9Y250 596 aa23.62■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ANGPT2O15123 496 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 VPS26AO75436 327 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TSPAN8P19075 237 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RETREG3Q86VR2 466 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CFAP52Q8N1V2 620 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TRPC4APQ8TEL6 797 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 RMDN1Q96DB5 314 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TTPALQ9BTX7 342 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TUBB1Q9H4B7 451 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HCSTQ9UBK5 93 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 POLG2Q9UHN1 485 aa23.61■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SUPT3HB4E1H0 165 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SUPT3HO75486 399 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ECI2O75521 394 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 F11P03951 625 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TFAP2AP05549 437 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 UROSP10746 265 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PKMP14618 531 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ATF6P18850 670 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GEN1Q17RS7 908 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 LCN8Q6JVE9 175 aa23.6■■□□□ 1.37
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PMS1-205ENST00000409985 EXT2Q93063 718 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 C19orf43Q9BQ61 176 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 TRIM54Q9BYV2 358 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 SLC52A3Q9NQ40 469 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 A0A1B0GVM2 712 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 BAIAP3O94812 1187 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ESRRBO95718 433 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CHEK2O96017 543 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 ARSAP15289 507 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 PSMC3P17980 439 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 FMO4P31512 558 aa23.6■■□□□ 1.37
PMS1-205ENST00000409985 CDKL1Q00532 357 aa23.6■■□□□ 1.37
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