RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 GPRC6AQ5T6X5 926 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZNF549Q6P9A3 640 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CMC1Q7Z7K0 106 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 OR2T34Q8NGX1 318 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SERAC1Q96JX3 654 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TCF12Q99081 682 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GPR22Q99680 433 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SGK2Q9HBY8 427 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 INVSQ9Y283 1065 aa25.2■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GOLGA8RI6L899 631 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SLC31A1O15431 190 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 FMO4P31512 558 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 DPTQ07507 201 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TRABD2AQ86V40 505 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TLCD1Q96CP7 247 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SLC17A9Q9BYT1 436 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 KDM4CQ9H3R0 1056 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 USP34Q70CQ2 3546 aa25.19■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RAD51BO15315 384 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GMPRP36959 345 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GPR1P46091 355 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 PPARDQ03181 441 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SGCGQ13326 291 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 IRF4Q15306 451 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 LGSNQ5TDP6 509 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 AGBL2Q5U5Z8 902 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TSSK4Q6SA08 328 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CERS6Q6ZMG9 384 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TRIM74Q86UV6 250 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CLDN19Q8N6F1 224 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GDAP1Q8TB36 358 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 FAM136AQ96C01 138 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ELMO2Q96JJ3 720 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MED4Q9NPJ6 270 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SMOXQ9NWM0 555 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 LRRC72A6NJI9 287 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TPP1O14773 563 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CNTFP26441 200 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CCR3P51677 355 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 B4GALNT1Q00973 533 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 DMWDQ09019 674 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GPS2Q13227 327 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 LRRC14Q15048 493 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 NEK5Q6P3R8 708 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 EXOC3L1Q86VI1 746 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 C4orf33Q8N1A6 199 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CAMKK1Q8N5S9 505 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 DTX3LQ8TDB6 740 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 BIRC8Q96P09 236 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GPR174Q9BXC1 333 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 PRSS21Q9Y6M0 314 aa25.18■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CD6P30203 668 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CLCN5P51795 746 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZNF460Q14592 562 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 AGERQ15109 404 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 BTN2A2Q8WVV5 523 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 GLYATL1Q969I3 302 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ULK4Q96C45 1275 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 OLFM1Q99784 485 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 EML5Q05BV3 1969 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 ZNF217O75362 1048 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RFPL1O75677 317 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 PTGER3P43115 390 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MAP7D1Q3KQU3 841 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CTSL3PQ5NE16 218 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MTBPQ96DY7 904 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 COPS8Q99627 209 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 IER2Q9BTL4 223 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 MT-ND3P03897 115 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CDKN2DP55273 166 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TAS2R39P59534 338 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 USP10Q14694 798 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 PNCKQ6P2M8 343 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 TRIM69Q86WT6 500 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 CEP97Q8IW35 865 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 RBFAQ8N0V3 343 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 VPS35Q96QK1 796 aa25.16■■□□□ 1.62
SNX15-202ENST00000377244 P2RY12Q9H244 342 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms