RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 AGAP14A8MT82 685 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PRRT4C9JH25 899 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 MATN2O00339 956 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SMIM24O75264 130 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CBX6O95503 412 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CTSLP07711 333 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SERPINA6P08185 405 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UGT1A6P19224 532 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UGT1A1P22309 533 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UGT1A4P22310 534 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UGT1A3P35503 534 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UGT1A5P35504 534 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 KRT72Q14CN4 511 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 AGR3Q8TD06 166 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 NXPE3Q969Y0 559 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ATOH8Q96SQ7 321 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TUBB6Q9BUF5 446 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 MTG2Q9H4K7 406 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.12■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 C1SP09871 688 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TPBGLP0DKB5 382 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 IMPDH1P20839 514 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 EPGNQ6UW88 154 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 VITQ6UXI7 678 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 STAG3L4Q8TBR4 150 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 L3HYPDHQ96EM0 354 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ABHD8Q96I13 439 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 BOCQ9BWV1 1114 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SLCO1B7G3V0H7 640 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 KERAO60938 352 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TSPAN12O95859 305 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF30P17039 623 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CLCN7P51798 805 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 IL2P60568 153 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 NXPE1Q8N323 547 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 HCAR2Q8TDS4 363 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 DKK3Q9UBP4 350 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 GNPTGQ9UJJ9 305 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TRIM33Q9UPN9 1127 aa24.11■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 IQCF5A8MTL0 148 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 HDAC3O15379 428 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 DIAPH2O60879 1101 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 MTHFD2P13995 350 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SPINT3P49223 89 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TIFAQ96CG3 184 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ARL8BQ9NVJ2 186 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ARMCX1Q9P291 453 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 VTI1BQ9UEU0 232 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 DHRS7Q9Y394 339 aa24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CCDC189A1A4V9 331 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 TIMP2P16035 220 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 NFKBIAP25963 317 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 VIPR1P32241 457 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 RASSF2P50749 326 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ARHGEF7Q14155 803 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF678Q5SXM1 525 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 FRMD7Q6ZUT3 714 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 ZNF366Q8N895 744 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 KDM1BQ8NB78 822 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 LRMDAQ9H2I8 198 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 IKZF3Q9UKT9 509 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 RNF112Q9ULX5 631 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SORCS3Q9UPU3 1222 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 CAPN14A8MX76 684 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 UBXN8O00124 270 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 HERVK_113P63132 956 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 KDSRQ06136 332 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 RFLNAQ6ZTI6 216 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 MAPK15Q8TD08 544 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 INPP5DQ92835 1189 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 EXT2Q93063 718 aa24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SERF1A-202ENST00000354833 LINGO1Q96FE5 620 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms