RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327359.7

BRF1-201, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene BRF1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-201ENST00000327359 SHMT2P34897 504 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PYCR3Q53H96 274 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 LINC00523Q86TU6 105 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PNPLA1Q8N8W4 532 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RAET1EQ8TD07 263 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 LRRC58Q96CX6 371 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CCDC126Q96EE4 140 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TMEM209Q96SK2 561 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DKK3Q9UBP4 350 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SEPT3Q9UH03 358 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SRRDQ9UH36 339 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CDH9Q9ULB4 789 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 VWA7Q9Y334 891 aa15.95■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 MTSS1O43312 755 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 BDNFP23560 247 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 POU4F1Q01851 419 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 IPMKQ8NFU5 416 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DPF3Q92784 378 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 MYLPFQ96A32 169 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CCDC138Q96M89 665 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SLC30A3Q99726 388 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 V9GYQ6 96 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 HTTP42858 3142 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SUPT7LO94864 414 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ODC1P11926 461 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 NR4A1P22736 598 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 AQP6Q13520 282 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 GRB7Q14451 532 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SPCS2Q15005 226 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 KCNJ8Q15842 424 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 AGAP9Q5VTM2 703 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 METTL23Q86XA0 190 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 EDEM1Q92611 657 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PSD2Q9BQI7 771 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 OSBPL10Q9BXB5 764 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 MROQ9BYG7 248 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 KLHL3Q9UH77 587 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 FBXO5Q9UKT4 447 aa15.94■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 AP3B1O00203 1094 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CAPN15O75808 1086 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 FYNP06241 537 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PCSK1P29120 753 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 GSK3BP49841 420 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DAOAP59103 153 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RABL3Q5HYI8 236 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PERM1Q5SV97 790 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 BROXQ5VW32 411 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CD300LGQ6UXG3 332 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ITIH5Q86UX2 942 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SFRP1Q8N474 314 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 41.2
BRF1-201ENST00000327359 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ZNF347Q96SE7 839 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 VAT1Q99536 393 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 SACM1LQ9NTJ5 587 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ZNF639Q9UID6 485 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DSEQ9UL01 958 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CKBP12277 381 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 IMPDH1P20839 514 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 DNAJB2P25686 324 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 KCNC1P48547 511 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PLA2G16P53816 162 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 CDH13P55290 713 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.93■□□□□ 0.14
BRF1-201ENST00000327359 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms