RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 FRMD7Q6ZUT3 714 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 BRD9Q9H8M2 597 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TCF7L2Q9NQB0 619 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 EPOPA6NHQ4 379 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CDC7O00311 574 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SUPT7LO94864 414 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN12O95859 305 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TSPAN8P19075 237 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ITGALP20701 1170 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 DGKGP49619 791 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 KCNC3Q14003 757 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TAS2R1Q9NYW7 299 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 TAGLN3Q9UI15 199 aa22.59■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 WASH3PC4AMC7 463 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ARSAP15289 507 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 AOC1P19801 751 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 CD9P21926 228 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ATP6V0D1P61421 351 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 PFKFB4Q16877 469 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 UNC50Q53HI1 259 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 FGF13Q92913 245 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 ASB16Q96NS5 453 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 IGFLR1Q9H665 355 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 FIS1Q9Y3D6 152 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.58■■□□□ 1.21
VSTM4-201ENST00000298454 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 KERAO60938 352 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CLCN7P51798 805 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 HERVK_113P63132 956 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 MESP2Q0VG99 397 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TBCCQ15814 346 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CUZD1Q86UP6 607 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO27Q8NI29 283 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LINGO1Q96FE5 620 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 EBF3Q9H4W6 596 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RNF112Q9ULX5 631 aa22.57■■□□□ 1.2
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VSTM4-201ENST00000298454 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 BTN3A1O00481 513 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GYG2O15488 501 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ACRV1P26436 265 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 NNMTP40261 264 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 BPIFB1Q8TDL5 484 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PRSS21Q9Y6M0 314 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.57■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 TULP3O75386 442 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LEFTY1O75610 366 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PAPLNO95428 1278 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ADH1CP00326 375 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FSHRP23945 695 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 CDH13P55290 713 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 IL2P60568 153 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ARSIQ5FYB1 569 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PLPP6Q8IY26 295 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 RBFAQ8N0V3 343 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF366Q8N895 744 aa22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
VSTM4-201ENST00000298454 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.56■■□□□ 1.2
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