RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262963.10

PTPRS-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-201ENST00000262963 GRIA1P42261 906 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TSTD2Q5T7W7 516 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CRTC3Q6UUV7 619 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TMEM110Q86TL2 294 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 OR7D4Q8NG98 312 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TSSK3Q96PN8 268 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PNPLA3Q9NST1 481 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 IGSF9Q9P2J2 1179 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 EGFL7Q9UHF1 273 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UBR2Q8IWV8 1755 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SLC7A4O43246 635 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HCRTO43612 131 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SCNN1AP37088 669 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 DPYSL2Q16555 572 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SYPL2Q5VXT5 272 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ISLR2Q6UXK2 745 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 GSTCDQ8NEC7 633 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MYDGFQ969H8 173 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FERD3LQ96RJ6 166 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 BCO2Q9BYV7 579 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SUV39H1O43463 412 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LRATO95237 230 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PRNPP04156 253 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 BMP7P18075 431 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ACAP2Q15057 778 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CCL14Q16627 93 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZYG11AQ6WRX3 759 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HDDC2Q7Z4H3 204 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FAM83DQ9H4H8 585 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FZD10Q9ULW2 581 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 INSIG1O15503 277 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 OR6B1O95007 311 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HIST1H2ABP04908 130 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 KIR3DL1P43629 444 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PRMT2P55345 433 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 COX10Q12887 443 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ZBTB2Q8N680 514 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 BANPQ8N9N5 519 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 HIST1H2ACQ93077 130 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 NPAS2Q99743 824 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AIF1LQ9BQI0 150 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 DNAJC28Q9NX36 388 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 NUDT4Q9NZJ9 180 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 FETUBQ9UGM5 382 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A9O60656 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ALOX12P18054 663 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SSR2P43308 183 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ASMTP46597 345 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CCR3P51677 355 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UGT2B15P54855 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ATP1A4Q13733 1029 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CPTPQ5TA50 214 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 B3GNT9Q6UX72 402 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CNTD1Q8N815 330 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 NTAN1Q96AB6 310 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 APOLD1Q96LR9 279 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A7Q9HAW7 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A10Q9HAW8 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 UGT1A8Q9HAW9 530 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 PRDM8Q9NQV8 689 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TCEA3O75764 348 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 MPP1Q00013 466 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 LCP2Q13094 533 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 ENKURQ8TC29 256 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 STRA6Q9BX79 667 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRS-201ENST00000262963 XYLT2Q9H1B5 865 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms