RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 HOXD13P35453 343 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TM4SF4P48230 202 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FBXW4P57775 412 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 GINS4Q9BRT9 223 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 A0A1W2PQH9 124 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 E9PBE3 544 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 BMP7P18075 431 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 MAGEA6P43360 314 aa6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SLC12A4Q9UP95 1085 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 M0QZQ0 153 aa6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 HM13Q8TCT9 377 aa6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SLITRK2Q9H156 845 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 PLCL1Q15111 1095 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 C2CD6Q53TS8 623 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 SHDQ96IW2 340 aa6.3□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FIZ1Q96SL8 496 aa6.3□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 DHRS12A0PJE2 317 aa6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 LGALS3BPQ08380 585 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRAF2Q12933 501 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 G3V2T6 193 aa6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 AGAP2Q99490 1192 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 MATN2O00339 956 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 SP2Q02086 613 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 TMC8Q8IU68 726 aa6.29□□□□□ -1.4
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SETX-201ENST00000224140 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.29□□□□□ -1.4
SETX-201ENST00000224140 ENDOD1O94919 500 aa6.29□□□□□ -1.4
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