RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 KCNC1P48547 511 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DNAJB13P59910 316 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 POU4F1Q01851 419 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 USP43Q70EL4 1123 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 AKT1S1Q96B36 256 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ASB7Q9H672 318 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 COMMD10Q9Y6G5 202 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 A0A1W2PQ67 120 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 OR51F1A6NGY5 319 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF487B1APH4 448 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CNTN5O94779 1100 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 GHRHRQ02643 423 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 LILRB4Q8NHJ6 448 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NUDT8Q8WV74 236 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 COPS5Q92905 334 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SPATA33Q96N06 139 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 KLK14Q9P0G3 267 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DKK3Q9UBP4 350 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NUAK1O60285 661 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ACADSBP45954 432 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SYT16Q17RD7 645 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HECTD2Q5U5R9 776 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 USP51Q70EK9 711 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 LEMD2Q8NC56 503 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FRS2Q8WU20 508 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FAM162AQ96A26 154 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ESAMQ96AP7 390 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TEX37Q96LM6 180 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NME7Q9Y5B8 376 aa13.04□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TRIM64A6NGJ6 449 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SLC1A7O00341 560 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ANGPTL1O95841 491 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 C1RP00736 705 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 C7P10643 843 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 IMPDH1P20839 514 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ADRA1BP35368 520 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 IFITM2Q01629 132 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RBBP7Q16576 425 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 LRIT3Q3SXY7 679 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 UNC50Q53HI1 259 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DESI1Q6ICB0 168 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ATL1Q8WXF7 558 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PROX1Q92786 737 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 WNT8BQ93098 351 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TEKT5Q96M29 485 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 KIFC1Q9BW19 673 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 C8orf4Q9NR00 106 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SNTG2Q9NY99 539 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 POLG2Q9UHN1 485 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DCLK1O15075 740 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CHRNA1P02708 482 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SPNP16150 400 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MAP3K7CLP57077 242 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CTF1Q16619 201 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DPY19L1Q2PZI1 675 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ZNF678Q5SXM1 525 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TTC39CQ8N584 583 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 DEPDC7Q96QD5 511 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HOXD1Q9GZZ0 328 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MOSPD1Q9UJG1 213 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 SPO11Q9Y5K1 396 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 BTAF1O14981 1849 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 MYO1GB0I1T2 1018 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 CDK14O94921 469 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 HTR1AP08908 422 aa13.03□□□□□ -0.32
ITGA3-201ENST00000007722 RACK1P63244 317 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms