RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TEX11	Q8IYF3	940 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMED6	Q8WW62	240 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ORAI1	Q96D31	301 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SCMH1	Q96GD3	660 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CALML4	Q96GE6	196 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FEM1C	Q96JP0	617 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MARK4	Q96L34	752 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CSF3R	Q99062	836 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	WAC	Q9BTA9	647 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CD93	Q9NPY3	652 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NENF	Q9UMX5	172 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CMAHP	Q9Y471	501 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NFS1	Q9Y697	457 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PP11	408 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KCNN4	O15554	427 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	KDM4B	O94953	1096 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CLDN14	O95500	239 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SELL	P14151	372 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PLA2G2A	P14555	144 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	UGT1A1	P22309	533 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC15A1	P46059	708 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MMP14	P50281	582 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PDLIM4	P50479	330 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PNLIPRP2	P54317	469 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CLDN20	P56880	219 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DSCR9	P59020	149 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PSMC6	P62333	389 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TUBA1B	P68363	451 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZXDB	P98169	803 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	STK4	Q13043	487 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MYBPH	Q13203	477 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PCLAF	Q15004	111 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CALCRL	Q16602	461 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM198	Q66K66	360 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OR8K5	Q8NH50	307 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	THAP6	Q8TBB0	222 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NEUROG1	Q92886	237 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	DACH2	Q96NX9	599 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GAD1	Q99259	594 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SIL1	Q9H173	461 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SELENON	Q9NZV5	590 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	STK39	Q9UEW8	545 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SIX4	Q9UIU6	781 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PADI1	Q9ULC6	663 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	LACTBL1	A8MY62	500 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175		B4DLN1	442 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	ENTPD3	O75355	529 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	PMS2P2	O95744	297 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	SNHG28	P0DPA3	235 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	NR2F1	P10589	423 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	S1PR1	P21453	382 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATRX-223	ENST00000637175	GCH1	P30793	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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