RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DYDC1Q8WWB3 177 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB7BQ96AH8 199 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ELFN1P0C7U0 828 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FDXRP22570 491 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DRD3P35462 400 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CDKN2DP55273 166 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 IRF9Q00978 393 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN1Q12860 1018 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF460Q14592 562 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD3Q14849 445 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DBN1Q16643 649 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXO43Q4G163 708 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM52BQ4KMG9 183 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 HHATQ5VTY9 493 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZVL8 140 aa24.74■■□□□ 1.55
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CAPNS1-215ENST00000628018 CKAP2Q8WWK9 683 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 BIRC8Q96P09 236 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CDH19Q9H159 772 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FBRSQ9HAH7 460 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CD84Q9UIB8 345 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT9Q9Y305 439 aa24.74■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQF6 199 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MID1O15344 667 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1I1O60431 355 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXNA2O75051 1894 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 COL6A2P12110 1019 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB2P14652 356 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GM2AP17900 193 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 C5AR1P21730 350 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ACRV1P26436 265 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FMO4P31512 558 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV3P41162 512 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LIG3P49916 1009 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS14P62263 151 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 IL9RQ01113 521 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CCINQ13939 588 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TERF2Q15554 542 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LCA5Q86VQ0 697 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 AADATQ8N5Z0 425 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC1Q99614 292 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY12Q9H244 342 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM83DQ9H4H8 585 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CD248Q9HCU0 757 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CRLS1Q9UJA2 301 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 EMCNQ9ULC0 261 aa24.73■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087X1B8 175 aa24.72■■□□□ 1.55
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CAPNS1-215ENST00000628018 ITGA9Q13797 1035 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 NXPE1Q8N323 547 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 COQ10AQ96MF6 247 aa24.72■■□□□ 1.55
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF358Q9NW07 568 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.72■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PKMP14618 531 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 COL9A1P20849 921 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf46Q6P387 395 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC91Q7Z6B0 441 aa24.71■■□□□ 1.55
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CAPNS1-215ENST00000628018 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC68Q9H2F9 335 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 POPDC3Q9HBV1 291 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MED16Q9Y2X0 877 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 COMMD10Q9Y6G5 202 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG2BQ96BY7 2078 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ESR1P03372 595 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CD72P21854 359 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOX1Q15067 660 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
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CAPNS1-215ENST00000628018 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 AGBL4Q5VU57 503 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2U1Q7Z449 544 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RBFAQ8N0V3 343 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC2Q8NEN0 867 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAMP4Q969E2 229 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ULK4Q96C45 1275 aa24.71■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEB18Q96M61 343 aa24.71■■□□□ 1.55
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