RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SLC39A1Q9NY26 324 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 IFNKQ9P0W0 207 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TBC1D29Q9UFV1 150 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 KCNK6Q9Y257 313 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 RELNP78509 3460 aa12.01□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 A6NCN8 305 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 EFCAB7A8K855 629 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 MATN3O15232 486 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SUV39H1O43463 412 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 MMP2P08253 660 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ACP5P13686 325 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ATP1A2P50993 1020 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TAS2R40P59535 323 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 GPLD1P80108 840 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 HHEXQ03014 270 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 LRP8Q14114 963 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SNAP47Q5SQN1 464 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TMEM71Q6P5X7 295 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 LRRC49Q8IUZ0 686 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 IL22RA1Q8N6P7 574 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PQLC3Q8N755 202 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 EXD1Q8NHP7 514 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 COL26A1Q96A83 441 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 FAF2Q96CS3 445 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SLC38A3Q99624 504 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 BRD8Q9H0E9 1235 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 VPS18Q9P253 973 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PDP2Q9P2J9 529 aa12□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 A8MU76 341 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 B4E171 279 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 MYO1FO00160 1098 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZW10O43264 779 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CBFA2T2O43439 604 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 DUX1O43812 170 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 RAD1O60671 282 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ASMTLO95671 621 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 GYPCP04921 128 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SERPING1P05155 500 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TSPAN7P41732 249 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 SPINT3P49223 89 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CSRP3P50461 194 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNF75DP51815 510 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZBTB17Q13105 803 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 NFATC2Q13469 925 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PEX6Q13608 980 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 QPCTQ16769 361 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CCDC122Q5T0U0 273 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 XKR5Q6UX68 686 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 NLRP8Q86W28 1048 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 NRSN1Q8IZ57 195 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 OR10G6Q8NH81 332 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 FATE1Q969F0 183 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 EID2BQ96D98 161 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 RTP4Q96DX8 246 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TSGA13Q96PP4 275 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 LYSMD1Q96S90 227 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CTRCQ99895 268 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNF670Q9BS34 389 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 TRIM5Q9C035 493 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTIF-208ENST00000590422 APMAPQ9HDC9 416 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ARFGAP3Q9NP61 516 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 IL17BQ9UHF5 180 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.99□□□□□ -0.49
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CTIF-208ENST00000590422 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 KCNK1O00180 336 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PPFIA2O75334 1257 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PROSCO94903 275 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PYGLP06737 847 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CCNCP24863 283 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 CD86P42081 329 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 MAPK9P45984 424 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 POLE2P56282 527 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 ZBED6P86452 979 aa11.98□□□□□ -0.49
CTIF-208ENST00000590422 GALNT3Q14435 633 aa11.98□□□□□ -0.49
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