RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582486.5

GGA3-213, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene GGA3, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-213	ENST00000582486	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	APPL1	Q9UKG1	709 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486		A8MT66	165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IQCF5	A8MTL0	148 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ZNF195	O14628	629 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CTSL	P07711	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CHRM3	P20309	590 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SPAM1	P38567	509 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NCALD	P61601	193 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RCN2	Q14257	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SNX20	Q7Z614	316 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	STK40	Q8N2I9	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63	5e-7	■■■■□ 23.5
GGA3-213	ENST00000582486	PHF21B	Q96EK2	531 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RILP	Q96NA2	401 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	VPS26A	O75436	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	UNC5C	O95185	931 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CBX6	O95503	412 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ESR1	P03372	595 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ASL	P04424	464 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PYGL	P06737	847 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	T-ENOL	P0DO92	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ITGAL	P20701	1170 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DNAJB13	P59910	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ASPH	Q12797	758 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	OR4D1	Q15615	310 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	VIT	Q6UXI7	678 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	LSMEM2	Q8N112	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TMEM237	Q96Q45	408 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	BOC	Q9BWV1	1114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CDH19	Q9H159	772 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	OBP2A	Q9NY56	170 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486		A0A1W2PQ67	120 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486		E5RI56	91 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	FCHO1	O14526	889 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	MPST	P25325	297 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ST8SIA6	P61647	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	KDSR	Q06136	332 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CFAP157	Q5JU67	520 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	EXT2	Q93063	718 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	TIFA	Q96CG3	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	IL36A	Q9UHA7	158 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA3-213	ENST00000582486	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.12	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms