RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC26A3P40879 764 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 TMED1Q13445 227 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRP8Q14114 963 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR180Q86V85 440 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 GPR158Q5T848 1215 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM156AQ8NDB6 213 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNIP2Q8NFZ5 429 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 L3HYPDHQ96EM0 354 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 CERS4Q9HA82 394 aa20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.23■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPBAP1Q96EW2 488 aa20.22■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF678Q5SXM1 525 aa20.22■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 Q7L0L9 218 aa20.22■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.22■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.22■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 VWA8A3KMH1 1905 aa20.21■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 IL10RBQ08334 325 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXL22Q6P050 247 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.21■□□□□ 0.83
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CCNDBP1-205ENST00000564630 PIM3Q86V86 326 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 ISOC1Q96CN7 298 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC29A1Q99808 456 aa20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC01553A4QN01 128 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SUPT7LO94864 414 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 EOMESO95936 686 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
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