RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557654.5

GPHN-215, Transcript of gephyrin, human

TSL 4

Gene GPHN, Length 503 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPHN-215	ENST00000557654	TBATA	Q96M53	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ACOX2	Q99424	681 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MMP28	Q9H239	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PPH5	198 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	C1orf226	A1L170	272 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PBX3	P40426	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TAS2R38	P59533	333 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FOXM1	Q08050	763 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	INSR	P06213	1382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	P2RY10	O00398	339 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SPINT2	O43291	252 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PAGE4	O60829	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FMO5	P49326	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	OLR1	P78380	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	APBB2	Q92870	758 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654		A0A1W2PQF6	199 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	CAPN9	O14815	690 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SOCS5	O75159	536 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KCNK5	O95279	499 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SPARC	P09486	303 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	USP8	P40818	1118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	CCR9	P51686	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	OLIG2	Q13516	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PIGT	Q969N2	578 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ALG14	Q96F25	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	PTPRC	P08575	1304 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	FGF17	O60258	216 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SLC22A3	O75751	556 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	SEC14L2	O76054	403 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	MLYCD	O95822	493 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	CLDN20	P56880	219 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GPHN-215	ENST00000557654	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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