RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 ZNF366Q8N895 744 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 IPMKQ8NFU5 416 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 UCMAQ8WVF2 138 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MSANTD3Q96H12 275 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MAP6Q96JE9 813 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 FEM1CQ96JP0 617 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SERPINB12Q96P63 405 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TRIB3Q96RU7 358 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ACOX2Q99424 681 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 APOL2Q9BQE5 337 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 FICDQ9BVA6 458 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 HDAC8Q9BY41 377 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TXLNGYQ9BZA5 131 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TMEM245Q9H330 911 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MTG2Q9H4K7 406 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 CASS4Q9NQ75 786 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 WASH3PC4AMC7 463 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 E7ESA3 106 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SOCS5O75159 536 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 AVILO75366 819 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 BANF1O75531 89 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 POP4O95707 220 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EGFP01133 1207 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PRLP01236 227 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EPOP01588 193 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 HLA-EP13747 358 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PRKCHP24723 683 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 GKP32189 559 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 IL12RB1P42701 662 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ARL4CP56559 192 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ST8SIA6P61647 398 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 RNF4P78317 190 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MTM1Q13496 603 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MYLK3Q32MK0 819 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 MAP9Q49MG5 647 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EMC10Q5UCC4 262 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 EMBQ6PCB8 327 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 RANBP10Q6VN20 620 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TPRG1Q6ZUI0 275 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 LINC00523Q86TU6 105 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 CCDC25Q86WR0 208 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 RELL1Q8IUW5 271 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PDIK1LQ8N165 341 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 CHST14Q8NCH0 376 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ANKRD7Q92527 254 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 PTPRN2Q92932 1015 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 CAVIN3Q969G5 261 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ASB2Q96Q27 587 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 SLC8A2Q9UPR5 921 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.09□□□□□ -1.11
BEST3-211ENST00000552295 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 DYNC1I1O14576 645 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 RGS13O14921 159 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 NPC1O15118 1278 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 ERLIN1O75477 346 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 PIGNO95427 931 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 NDST3O95803 873 aa8.08□□□□□ -1.12
BEST3-211ENST00000552295 CTSLP07711 333 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms