RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ASB12Q8WXK4 309 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SCRN2Q96FV2 425 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HES6Q96HZ4 224 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TEKT5Q96M29 485 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GLOD4Q9HC38 313 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PCDH9Q9HC56 1237 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 UBP1Q9NZI7 540 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KLK10O43240 276 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DFNA5O60443 496 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SDC3O75056 442 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PCCBP05166 539 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GM2AP17900 193 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 VIPR1P32241 457 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PTPN7P35236 360 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NFATC3Q12968 1075 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 XRCC4Q13426 336 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 INPP5AQ14642 412 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NOMO1Q15155 1222 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 IRF4Q15306 451 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CNGA3Q16281 694 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RFLNAQ6ZTI6 216 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NDUFAF2Q8N183 169 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ZNF567Q8N184 647 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KCNE4Q8WWG9 221 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 A0A0J9YYE9 177 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CFAP69A5D8W1 941 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HACD1B0YJ81 288 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ANKRD66B4E2M5 251 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PMPCBO75439 489 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CLDN7O95471 211 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 TRBC1P01850 177 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PIRTP0C851 137 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RBP3P10745 1247 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NFKB1P19838 968 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CA4P22748 312 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 LHCGRP22888 699 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 NFKBIAP25963 317 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MAP2K3P46734 347 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RABIFP47224 123 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RXRGP48443 463 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 THOP1P52888 689 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 PFN3P60673 137 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ARHGEF7Q14155 803 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 FZD2Q14332 565 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 GALNT3Q14435 633 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 RPS6KA1Q15418 735 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MEI1Q5TIA1 1274 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 LRRC66Q68CR7 880 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 ZNF662Q6ZS27 426 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 Q6ZVL8 140 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 USP45Q70EL2 814 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 SAP25Q8TEE9 199 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 HIC2Q96JB3 615 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 COQ10AQ96MF6 247 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 APOOQ9BUR5 198 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 CD84Q9UIB8 345 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-217ENST00000550044 KLF15Q9UIH9 416 aa9.61□□□□□ -0.87
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