RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa21.83■■□□□ 1.09
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PI15O43692 258 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF30P17039 623 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 LIG3P49916 1009 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CDKN2DP55273 166 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 NFATC2Q13469 925 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 STARD3Q14849 445 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ERAP2Q6P179 960 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF398Q8TD17 642 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 NAT14Q8WUY8 206 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SCAMP4Q969E2 229 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ASB8Q9H765 288 aa21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 C2P06681 752 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINB8P50452 374 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 IRF9Q00978 393 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SYT13Q7L8C5 426 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SNX20Q7Z614 316 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 OR2T3Q8NH03 318 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PPP1R16AQ96I34 528 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 APOPT1Q96IL0 206 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 BIRC8Q96P09 236 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TCF12Q99081 682 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF358Q9NW07 568 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 APPL1Q9UKG1 709 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 GRID1Q9ULK0 1009 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.82■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 AGAP14A8MT82 685 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 HOXB2P14652 356 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 FMO4P31512 558 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC18A1P54219 525 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PTPN5P54829 565 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TAS2R38P59533 333 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 DBN1Q16643 649 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 HECTD2Q5U5R9 776 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 MAMSTRQ6ZN01 415 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SERPINA9Q86WD7 417 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 VPS11Q9H270 941 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 DYRK4Q9NR20 520 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 VWA7Q9Y334 891 aa21.81■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 FADS3Q9Y5Q0 445 aa21.81■■□□□ 1.08
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PACSIN3-209ENST00000532457 A0A096LPK6 155 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 COPEO14579 308 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 GPR37L1O60883 481 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 DNAJC6O75061 913 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFS3O75489 264 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 COQ10AQ96MF6 247 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 BOCQ9BWV1 1114 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 MED16Q9Y2X0 877 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PRR33A8MZF0 331 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 MMP20O60882 483 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC35E2BP0CK96 405 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CRHR1P34998 444 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 POU4F1Q01851 419 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 MTAPQ13126 283 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 GAS6Q14393 721 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 AGBL4Q5VU57 503 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 C16orf46Q6P387 395 aa21.8■■□□□ 1.08
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PACSIN3-209ENST00000532457 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ABCG8Q9H221 673 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 MKS1Q9NXB0 559 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 EMCNQ9ULC0 261 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 PLLPQ9Y342 182 aa21.8■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CUL9Q8IWT3 2517 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1W2PP55 124 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ELFN1P0C7U0 828 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 C5AR1P21730 350 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 ETV4P43268 484 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 POLD2P49005 469 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 TTPAP49638 278 aa21.79■■□□□ 1.08
PACSIN3-209ENST00000532457 CCR3P51677 355 aa21.79■■□□□ 1.08
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