RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 NAT9Q9BTE0 207 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PCED1AQ9H1Q7 454 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 IL17CQ9P0M4 197 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 BTBD3Q9Y2F9 522 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PLXNA2O75051 1894 aa16.78■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 COL6A6A6NMZ7 2263 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 RGSL1A5PLK6 1076 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CLDN7O95471 211 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 C1SP09871 688 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 LPOP22079 712 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CD6P30203 668 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ACSL1P33121 698 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PTSQ03393 145 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 ARHGEF7Q14155 803 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 NUMA1Q14980 2115 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 BBS9Q3SYG4 887 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CCDC38Q502W7 563 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TMEM135Q86UB9 458 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TRIM69Q86WT6 500 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 CCNJLQ8IV13 435 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 OR14C36Q8NHC7 312 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 PARD6BQ9BYG5 372 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 GPR63Q9BZJ6 419 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TREX1Q9NSU2 369 aa16.77■□□□□ 0.28
PACS1-208ENST00000529677 TMEM131Q92545 1883 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 COL12A1Q99715 3063 aa16.77■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 LRRC72A6NJI9 287 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 C2orf81A6NN90 581 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 BANF1O75531 89 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SEMA4FO95754 770 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ELFN1P0C7U0 828 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 C6P13671 934 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ELK3P41970 407 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 LIG3P49916 1009 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CCR5P51681 352 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CRADDP78560 199 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SEMG2Q02383 582 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 MTM1Q13496 603 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TSTD2Q5T7W7 516 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 STEAP4Q687X5 459 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FAM124AQ86V42 546 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 IGDCC3Q8IVU1 814 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DTX3LQ8TDB6 740 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CXorf40AQ8TE69 158 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 STYXQ8WUJ0 223 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 KCTD5Q9NXV2 234 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 KCTD3Q9Y597 815 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ARL5AQ9Y689 179 aa16.76■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 A0A0U1RQS6 177 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 H7C0S8 307 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NEMP1O14524 444 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 LATO43561 262 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PGAM1P18669 254 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DCDC1P59894 354 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 RPS21P63220 83 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SEPT6Q14141 434 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 HORMAD1Q86X24 394 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 NRSN1Q8IZ57 195 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 OR13J1Q8NGT2 312 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 DTD2Q96FN9 168 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CDH19Q9H159 772 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SAYSD1Q9NPB0 183 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 RAD18Q9NS91 495 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.75■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PQU0 124 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 A8MX80 341 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 MMP20O60882 483 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 USP1O94782 785 aa16.74■□□□□ 0.27
PACS1-208ENST00000529677 PCDH8O95206 1070 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms