RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 VPS18Q9P253 973 aa18.58■□□□□ 0.57
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PTPRK-218ENST00000525459 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa18.55■□□□□ 0.56
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PTPRK-218ENST00000525459 ELK3P41970 407 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 ARSDP51689 593 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 FZD2Q14332 565 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
PTPRK-218ENST00000525459 ZBED8Q8IZ13 594 aa18.54■□□□□ 0.56
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