RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNG1Q06432 222 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PNCKQ6P2M8 343 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 MREGQ8N565 214 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LGR4Q9BXB1 951 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZFATQ9P243 1243 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CRLS1Q9UJA2 301 aa22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PRR33A8MZF0 331 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTA2P09210 222 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGALP20701 1170 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC3Q5W041 872 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX20Q7Z614 316 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAM1L1Q8N609 369 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ORAI3Q9BRQ5 295 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 BOCQ9BWV1 1114 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ACSS3Q9H6R3 686 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.57■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM23A6NLE4 172 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL12A8MUP2 240 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SPAG6O75602 509 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TSHRP16473 764 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRB3P28472 473 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CCR5P51681 352 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DPTQ07507 201 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LAYNQ6UX15 382 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GDAP1Q8TB36 358 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SERAC1Q96JX3 654 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PLAAQ9Y263 795 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCA7Q8IZY2 2146 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ABHD2P08910 425 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO1A2P46721 670 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DBN1Q16643 649 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF765Q7L2R6 523 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO5Q9UKT4 447 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CRYL1Q9Y2S2 319 aa22.56■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAH14Q0VDD8 3507 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 HAUS5O94927 633 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PMLP29590 882 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AGERQ15109 404 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GPRC6AQ5T6X5 926 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC36A4Q6YBV0 504 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GAB3Q8WWW8 586 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 BMFQ96LC9 184 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A18Q96N87 628 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CYTH2Q99418 400 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD18Q9NS91 495 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 MEI4A8MW99 385 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 AHSGP02765 367 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPN5P54829 565 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CASP8Q14790 479 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CNSTQ6PJW8 725 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 NXPE1Q8N323 547 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD7Q92527 254 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GLYATL1Q969I3 302 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM167BQ9BTA0 163 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH19Q9H159 772 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PPC4 97 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC34A2O95436 690 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 S1PR4O95977 384 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GCAP28676 217 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 PGGT1BP53609 377 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGA9Q13797 1035 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DOK6Q6PKX4 331 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CYS1Q717R9 158 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 DET1Q7L5Y6 550 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN19Q8N6F1 224 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 CADM4Q8NFZ8 388 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 BTN2A2Q8WVV5 523 aa22.54■■□□□ 1.2
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf43Q9BQ61 176 aa22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms