RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516577.1

RNU6-1018P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1018, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1018P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GJB7Q6PEY0 223 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VITQ6UXI7 678 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q6ZRP5 223 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RRAGAQ7L523 313 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRSS45Q7RTY3 260 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CEACAM19Q7Z692 300 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC47A2Q86VL8 602 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KIAA2013Q8IYS2 634 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBED8Q8IZ13 594 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 DCLK2Q8N568 766 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 Q8NBF4 154 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM178AQ8NBL3 297 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SCCPDHQ8NBX0 429 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPPL3Q8TCT6 385 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MIPOL1Q8TD10 442 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NCSTNQ92542 709 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 HSPH1Q92598 858 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGED4Q96JG8 741 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTRCQ99895 268 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MXRA8Q9BRK3 442 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NUF2Q9BZD4 464 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC32A1Q9H598 525 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SMYD2Q9NRG4 433 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PANK4Q9NVE7 773 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TAB2Q9NYJ8 693 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL9Q9P2J3 617 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MUTYHQ9UIF7 546 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CNPY2Q9Y2B0 182 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GON4LQ3T8J9 2241 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NACAE9PAV3 2078 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 VSTM5A8MXK1 200 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IDH3BO43837 385 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NBNO60934 754 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 WISP2O76076 250 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 C22orf31O95567 290 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IGKV3-11P04433 115 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ETFAP13804 333 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LIFP15018 202 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MGMTP16455 207 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NR2C2P49116 596 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PNLIPRP1P54315 467 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NR1H2P55055 460 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KRTAP12-4P60329 112 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PLIN5Q00G26 463 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 E2F5Q15329 346 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBRG1Q3YBR2 411 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTC22Q5TAA0 569 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TTI2Q6NXR4 508 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BRAT1Q6PJG6 821 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IL20RBQ6UXL0 311 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SYT13Q7L8C5 426 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC16A9Q7RTY1 509 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TBC1D26Q86UD7 250 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAP7D3Q8IWC1 876 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC35F3Q8IY50 421 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BEST3Q8N1M1 668 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SPATA6LQ8N4H0 392 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MAGEB6Q8N7X4 407 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TMEM143Q96AN5 459 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ORAI1Q96D31 301 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GIMAP5Q96F15 307 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 GRAMD2BQ96HH9 432 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 MGME1Q9BQP7 344 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 RHNO1Q9BSD3 238 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CLEC7AQ9BXN2 247 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 LRMDAQ9H2I8 198 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 NOD2Q9HC29 1040 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TNFRSF19Q9NS68 423 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TM7SF3Q9NS93 570 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 BABAM1Q9NWV8 329 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 ERAP1Q9NZ08 941 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 CTSZQ9UBR2 303 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 TUBE1Q9UJT0 475 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 SLC39A10Q9ULF5 831 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 KLHL20Q9Y2M5 609 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1018P-201ENST00000516577 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms