RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515430.5

FAM200B-221, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 2

Gene FAM200B, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-221	ENST00000515430	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.1	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	SPINT2	O43291	252 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	CTSV	O60911	334 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	POLB	P06746	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	HOXB5	P09067	269 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	CNTF	P26441	200 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	PGM1	P36871	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	VAMP2	P63027	116 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	PPP2R5B	Q15173	497 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	TAF12	Q16514	161 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	OR52I2	Q8NH67	350 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	ART5	Q96L15	291 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	GJD2	Q9UKL4	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430	UTY	O14607	1347 aa		4.09	□□□□□ -1.75
FAM200B-221	ENST00000515430		A0A0J9YWU9	116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	AMPH	P49418	695 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	MLLT10	P55197	1068 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CDH15	P55291	814 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	BIRC3	Q13489	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	NAE1	Q13564	534 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	NFIL3	Q16649	462 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	NCAM2	O15394	837 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PDE9A	O76083	593 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PYGL	P06737	847 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CSF2RA	P15509	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TDG	Q13569	410 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CAMK1	Q14012	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	BAK1	Q16611	211 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	GPR180	Q86V85	440 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	CIDEA	O60543	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TACC1	O75410	805 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	FTCD	O95954	541 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	DSCR10	P59022	87 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	SORD	Q00796	357 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	DECR1	Q16698	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
FAM200B-221	ENST00000515430	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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