RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RYKP34925 604 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINB9P50453 376 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STX17P56962 302 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DMWDQ09019 674 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TUSC3Q13454 348 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 POU6F1Q14863 301 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD5Q16401 504 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FUT10Q6P4F1 479 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP20A1Q6UW02 462 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FRMD5Q7Z6J6 570 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KBTBD6Q86V97 674 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CMIPQ8IY22 773 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA2013Q8IYS2 634 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TAGAPQ8N103 731 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LIX1Q8N485 282 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 STRA6Q9BX79 667 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ISCUQ9H1K1 167 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DPH5Q9H2P9 285 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AASSQ9UDR5 926 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MUC6Q6W4X9 2439 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ILVBLA1L0T0 632 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BLACEA4D250 179 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CCT8L1PA6NM43 557 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MXE2 369 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC22A1O15245 554 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR7A10O76100 309 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDH8O95206 1070 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MYBP10242 640 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PRPS2P11908 318 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C6P13671 934 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TNNI3P19429 210 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GRK3P35626 688 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RIDAP52758 137 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AP1S2P56377 157 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAD51Q06609 339 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ART3Q13508 389 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PDSS1Q5T2R2 415 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ATF7IP2Q5U623 682 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 IL27RAQ6UWB1 636 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CHSY3Q70JA7 882 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CENPSQ8N2Z9 138 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC5A11Q8WWX8 675 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ST8SIA2Q92186 375 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SEC14L1Q92503 715 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM143Q96AN5 459 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1F2PQ96R84 312 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GAD1Q99259 594 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ALG2Q9H553 416 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KCNK12Q9HB15 430 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 NINJ2Q9NZG7 142 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CDH7Q9ULB5 785 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 MYH6P13533 1939 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM172BPA6NC97 362 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC53A6NM62 1247 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MU76 341 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF879B4DU55 563 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 K7ERQ8 282 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CUTAO60888 179 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD10O75832 226 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RAB3DO95716 219 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CNPP09543 421 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GNSP15586 552 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 AHCYP23526 432 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PBX3P40426 434 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CAPZA1P52907 286 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ITGA8P53708 1063 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 DRG2P55039 364 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTR3P61158 418 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 GUCY1A3Q02108 690 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CAMK1Q14012 370 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 TSC22D1Q15714 1073 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS21Q2M5E4 152 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM171A1Q5VUB5 890 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 RESP18Q5W5W9 173 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 CREG2Q8IUH2 290 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 BANPQ8N9N5 519 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-213ENST00000496055 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms