RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495615.5

CBWD5-231, Transcript of COBW domain containing 5, human

TSL 3

Gene CBWD5, Length 993 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CBWD5-231	ENST00000495615	RGS2	P41220	211 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KRT81	Q14533	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	THAP6	Q8TBB0	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BMPR1B	O00238	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GPC4	O75487	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACADM	P11310	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LAMP2	P13473	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	S1PR1	P21453	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TAS2R38	P59533	333 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CRYM	Q14894	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	APBB2	Q92870	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CD101	Q93033	1021 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TIGD1	Q96MW7	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KAT14	Q9H8E8	782 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615		M0QZ24	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SH3BP5	O60239	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BAIAP3	O94812	1187 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CETP	P11597	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACTN1	P12814	892 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	UBA7	P41226	1012 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	FUT6	P51993	359 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ZNF132	P52740	706 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	MED22	Q15528	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	DECR1	Q16698	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PIGT	Q969N2	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	PTPRC	P08575	1304 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1W2PQF6	199 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615		A0A1W2PS18	150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CBWD5-231	ENST00000495615	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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