RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 DTD2Q96FN9 168 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TSPAN17Q96FV3 270 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 BIRC8Q96P09 236 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 VPS35Q96QK1 796 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 OLFM1Q99784 485 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ASB8Q9H765 288 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 KCNK9Q9NPC2 374 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 DCDC2Q9UHG0 476 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 MMP17Q9ULZ9 603 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SCML1Q9UN30 329 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ITM2BQ9Y287 266 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 MED16Q9Y2X0 877 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PLLPQ9Y342 182 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 EYSQ5T1H1 3165 aa11.42□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 F5P12259 2224 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087X1B8 175 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 A8MX80 341 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 MID1O15344 667 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFS3O75489 264 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ESR1P03372 595 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 C6P13671 934 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PMLP29590 882 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CA5AP35218 305 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CCT5P48643 541 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 LIG3P49916 1009 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TAS2R38P59533 333 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CHRNA6Q15825 494 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 EOGTQ5NDL2 527 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CTSL3PQ5NE16 218 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZVL8 140 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 NLRP8Q86W28 1048 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SERPINA9Q86WD7 417 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 RBFAQ8N0V3 343 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SYNPOQ8N3V7 929 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 GPATCH11Q8N954 259 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 KCNJ9Q92806 393 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ELMO2Q96JJ3 720 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 NDNQ99608 321 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 FAM83DQ9H4H8 585 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 THEGQ9P2T0 379 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SLC17A7Q9P2U7 560 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 WNT16Q9UBV4 365 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 EMCNQ9ULC0 261 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa11.41□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PLK4O00444 970 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 WNT9AO14904 365 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TSPAN6O43657 245 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CHRNB1P11230 501 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PKMP14618 531 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ETV3P41162 512 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CDKN2DP55273 166 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 STARD6P59095 220 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 IRF9Q00978 393 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 DPTQ07507 201 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CCDC15Q0P6D6 951 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 PPM1JQ5JR12 505 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF852Q6ZMS4 543 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 USP30Q70CQ3 517 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 TTC1Q99614 292 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ABCG8Q9H221 673 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 FAM96AQ9H5X1 160 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 SERGEFQ9UGK8 458 aa11.4□□□□□ -0.58
C9orf3-220ENST00000489318 CRLS1Q9UJA2 301 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms