RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461827.5

APOBEC3G-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3G, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-202ENST00000461827 PRKCEQ02156 737 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC18A3Q16572 532 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 Q6ZSN1 163 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 RUFY3Q7L099 469 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CHST9Q7L1S5 443 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 HACE1Q8IYU2 909 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 BLIDQ8IZY5 108 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 Q8NFD4 153 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TBCKQ8TEA7 893 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 WASF1Q92558 559 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 LENG9Q96B70 501 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MBOAT7Q96N66 472 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 HEMGNQ9BXL5 484 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 GALNT9Q9HCQ5 603 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PTPRSQ13332 1948 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 BICDL2A1A5D9 508 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CAPN14A8MX76 684 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 IFNL4K9M1U5 179 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 LAMTOR5O43504 91 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CHRM4P08173 479 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CYP4B1P13584 511 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 SELLP14151 372 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CD72P21854 359 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MATN1P21941 496 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TTKP33981 857 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 GPC5P78333 572 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 E2F1Q01094 437 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PPP2R5CQ13362 524 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CRYMQ14894 314 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 IL27RAQ6UWB1 636 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 RTL10Q7L3V2 364 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 GALNT7Q86SF2 657 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 C4orf19Q8IY42 314 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 VPS52Q8N1B4 723 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 JAKMIP2Q96AA8 810 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CCDC51Q96ER9 411 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 IGSF21Q96ID5 467 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 STRA6Q9BX79 667 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PEMTQ9UBM1 199 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 DKK3Q9UBP4 350 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MKLN1Q9UL63 735 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 VPS4AQ9UN37 437 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 KAT6AQ92794 2004 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 HIDE1A8MVS5 230 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 VWC2LB2RUY7 222 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 PAGE4O60829 102 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 STBD1O95210 358 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TUBBP07437 444 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 MCM3P25205 808 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 KLRC2P26717 231 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 DUSP1P28562 367 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 GJC1P36383 396 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 DIO1P49895 249 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 AGTR2P50052 363 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 RAD23AP54725 363 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CDH8P55286 799 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 LINC00310P59036 64 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TFDP1Q14186 410 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 IL13RA2Q14627 380 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 GXYLT1Q4G148 440 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 FBXO43Q4G163 708 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 CLLU1OSQ5K130 101 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-202ENST00000461827 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms