RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 NLNQ9BYT8 704 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 XPR1Q9UBH6 696 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 VPS28Q9UK41 221 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SNX6Q9UNH7 406 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.36□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 H3BRB1 525 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SULT1B1O43704 296 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ALDH2P05091 517 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 URODP06132 367 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TFEBP19484 476 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 GRK4P32298 578 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CSNK2BP67870 215 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ADGRE1Q14246 886 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CYP2A13Q16696 494 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 MTX3Q5HYI7 312 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 BORAQ6PGQ7 559 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CHMP1BQ7LBR1 199 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SLC51BQ86UW2 128 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ZNF366Q8N895 744 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 AP3S1Q92572 193 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PROX1Q92786 737 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TEKT5Q96M29 485 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 RNF145Q96MT1 663 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 KLHL31Q9H511 634 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 OPTCQ9UBM4 332 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PSME2Q9UL46 239 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 DERAQ9Y315 318 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SLC28A1O00337 649 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 WNT10BO00744 389 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ENPP3O14638 875 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 B4GALT5O43286 388 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 LTFP02788 710 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CTSHP09668 335 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 INSRRP14616 1297 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CTRB1P17538 263 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 NFKB1P19838 968 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ITGAXP20702 1163 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TRIM23P36406 574 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TTPAP49638 278 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PSMD5Q16401 504 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 Q3ZCU0 254 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CCDC58Q4VC31 144 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 STX12Q86Y82 276 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ZNF276Q8N554 614 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 HEXDCQ8WVB3 486 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SIAEQ9HAT2 523 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PADI4Q9UM07 663 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 POLHQ9Y253 713 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ADAM23O75077 832 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 TIPRLO75663 272 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ATP6AP2O75787 350 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 METTL18O95568 372 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ECDO95905 644 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 IL6P05231 212 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ACADVLP49748 655 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SLC7A2P52569 658 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 VBP1P61758 197 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PGS1Q32NB8 556 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 PMF1Q6P1K2 205 aa6.35□□□□□ -1.39
BDNF-211ENST00000439476 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.35□□□□□ -1.39
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