RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ILVBL	A1L0T0	632 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		F5H5T6	163 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PFDN6	O15212	129 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KDELR3	O43731	214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SERPINF2	P08697	491 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PML	P29590	882 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CDC25C	P30307	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC7A1	P30825	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR1G1	P47890	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARSD	P51689	593 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLCN4	P51793	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ACLY	P53396	1101 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	STX1B	P61266	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF235	Q14590	738 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF460	Q14592	562 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	IHH	Q14623	411 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PDK3	Q15120	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LIN52	Q52LA3	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AURKA	O14965	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NRP2	O60462	931 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KERA	O60938	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TIPRL	O75663	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CR2	P20023	1033 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPX3	P22352	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCNA5	P22460	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DPP6	P42658	865 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AQP4	P55087	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CDKN2D	P55273	166 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MS4A2	Q01362	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RHD	Q02161	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	BNIP2	Q12982	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCSK7	Q16549	785 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LPCAT4	Q643R3	524 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CWH43	Q9H720	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC78	A2IDD5	438 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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