RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 CYGBQ8WWM9 190 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF558Q96NG5 402 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KLHL4Q9C0H6 718 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 S100A14Q9HCY8 104 aa13.51□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 GNGT2O14610 69 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SYN3O14994 580 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TIPRLO75663 272 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 UGT2B4P06133 528 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC2A4P14672 509 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FOXA1P55317 472 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MTG2Q9H4K7 406 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 YIPF1Q9Y548 306 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 RAD54BQ9Y620 910 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MATN2O00339 956 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CYP11A1P05108 521 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP6V1C1P21283 382 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 BCL2L1Q07817 233 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 IL10RBQ08334 325 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF6Q15052 776 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TBCCQ15814 346 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 WLSQ5T9L3 541 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 STYXQ8WUJ0 223 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 DNAJC28Q9NX36 388 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 UNCXA6NJT0 531 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF487B1APH4 448 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OR4F21O95013 312 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OAZ2O95190 189 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 LRATO95237 230 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FGF1P05230 155 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPA7P48741 367 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 NDST2P52849 883 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA3AQ14563 771 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MTX3Q5HYI7 312 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PYCR2Q96C36 320 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KLQ9UEF7 1012 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CARD8Q9Y2G2 431 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 UPK3BL1B0FP48 263 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM114B3SHH9 223 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 UPK3BL2E5RIL1 263 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KLKB1P03952 638 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CSF2RAP15509 400 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 IL2P60568 153 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 STX5Q13190 355 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PARP15Q460N3 678 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C6orf52Q5T4I8 152 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ANO7Q6IWH7 933 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KBTBD2Q8IY47 623 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ELMOD1Q8N336 334 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PTERQ96BW5 349 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C8orf48Q96LL4 319 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ECSITQ9BQ95 431 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 VPS45Q9NRW7 570 aa13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 AZIN1O14977 448 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SCAMP1O15126 338 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KCNK10P57789 538 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TWIST2Q8WVJ9 160 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C19orf60Q96EN9 201 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CIB1Q99828 191 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CLIC5Q9NZA1 410 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 BCAP29Q9UHQ4 241 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 CROTQ9UKG9 612 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 BLOC1S6Q9UL45 172 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 TRIM43BA6NCK2 446 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 E7ENX8 843 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 DIO3P55073 304 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 ACTR3P61158 418 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM45BPQ6NSW5 357 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM45AQ8TCE6 357 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 VPS50Q96JG6 964 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 LMCD1Q9NZU5 365 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 LRCH1Q9Y2L9 728 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
RABGEF1-210ENST00000437078 GRID2O43424 1007 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms