RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 LRTM1Q9HBL6 345 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 GOT2P00505 430 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ELP6Q0PNE2 266 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM124AQ86V42 546 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 DUOX1Q9NRD9 1551 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PIPSLA2A3N6 862 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NFATC1O95644 943 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTM5P46439 218 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NEK10Q6ZWH5 1172 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD1Q9H3U5 465 aa21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 DYTNA2CJ06 578 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PGM3O95394 542 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 BIKQ13323 160 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CHSY3Q70JA7 882 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 OSBPL11Q9BXB4 747 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM63AO94886 807 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 MAPK11Q15759 364 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SYPL2Q5VXT5 272 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CLIP3Q96DZ5 547 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 IPPKQ9H8X2 491 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 KELP23276 732 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 BNIP1Q12981 228 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CPTPQ5TA50 214 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10G6Q8NH81 332 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TWNKQ96RR1 684 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 OR10H1Q9Y4A9 318 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPRJQ12913 1337 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINB7O75635 380 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC6A2P23975 617 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PQLC1Q8N2U9 271 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52L1Q8NGH7 329 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NTAN1Q96AB6 310 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.31■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PTSQ03393 145 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CLCQ05315 142 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 AZIN2Q96A70 460 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 AP2M1Q96CW1 435 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 AP4B1Q9Y6B7 739 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 IRAK2O43187 625 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SUV39H1O43463 412 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 WFS1O76024 890 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL18O95568 372 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TRBC1P01850 177 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 APODP05090 189 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 IL1R2P27930 398 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ACLYP53396 1101 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 LCP2Q13094 533 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CRHR2Q13324 411 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CLEC6AQ6EIG7 209 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 HPS6Q86YV9 775 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 DENND6AQ8IWF6 608 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CPA6Q8N4T0 437 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CACNG4Q9UBN1 327 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 EFCAB10A6NFE3 127 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC7A4O43246 635 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PRNPP04156 253 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CLN6Q9NWW5 311 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 CENPXA8MT69 81 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE9AO76083 593 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 POP4O95707 220 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 SSR2P43308 183 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 RPIAP49247 311 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 NR1H2P55055 460 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 FOLH1Q04609 750 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 DEPDC4Q8N2C3 294 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 PPM1MQ96MI6 270 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 HAPLN3Q96S86 360 aa21.3■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 TM7SF2O76062 418 aa21.29■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PTPRJ-201ENST00000418331 C21orf59P57076 290 aa21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms