RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 TNFRSF10CO14798 259 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM63AO94886 807 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM16O95361 564 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SLC4A1P02730 911 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PIRTP0C851 137 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 RPL21P46778 160 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SPINT3P49223 89 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 HK3P52790 923 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 CDK3Q00526 305 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 CALCOCO2Q13137 446 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 MORF4L2Q15014 288 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 CDKN3Q16667 212 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 ALG11Q2TAA5 492 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 DUPD1Q68J44 220 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 HID1Q8IV36 788 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 RBFAQ8N0V3 343 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 LMX1AQ8TE12 382 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TEX101Q9BY14 249 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 CDH19Q9H159 772 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 KLF15Q9UIH9 416 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SHOC2Q9UQ13 582 aa20.67■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SCAMP1O15126 338 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 GRIA1P42261 906 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 ITGA8P53708 1063 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SLC7A5Q01650 507 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PELI3Q8N2H9 469 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SCAMP4Q969E2 229 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PDXPQ96GD0 296 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 LRRC61Q9BV99 259 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 WHRNQ9P202 907 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.66■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 SLU7O95391 586 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 MLNP12872 115 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 CTSEP14091 401 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TPH1P17752 444 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 DCDC1P59894 354 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 ELOCQ15369 112 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 FGF22Q9HCT0 170 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 BFARQ9NZS9 450 aa20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
C4orf48-201ENST00000409248 PRSS38A1L453 326 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM202A6NGA9 273 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LMO7DNF2Z398 122 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM38O00635 465 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TPP1O14773 563 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SIGLEC6O43699 453 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CRTAMO95727 393 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SOD1P00441 154 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TNFP01375 233 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PMLP29590 882 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 GUCY2DQ02846 1103 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 FOXC1Q12948 553 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF534Q76KX8 674 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SERPINB12Q96P63 405 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LGR4Q9BXB1 951 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.64■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 C2orf81A6NN90 581 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 ANXA6P08133 673 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 CKMT2P17540 419 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 NPY2RP49146 381 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 DAB2P98082 770 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 PDE1BQ01064 536 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 LAMB3Q13751 1172 aa20.63■□□□□ 0.89
C4orf48-201ENST00000409248 SEPT6Q14141 434 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms