RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 DCAKDQ8WVC6 231 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RBBP8Q99708 897 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RHOJQ9H4E5 214 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.42■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PLXNA2O75051 1894 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SMIM23A6NLE4 172 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 AXIN1O15169 862 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 GCAP28676 217 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ACSL1P33121 698 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SLCO1A2P46721 670 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 CCR5P51681 352 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 LIMK2P53671 638 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 CTBP1Q13363 440 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SEL1L3Q68CR1 1132 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RBFAQ8N0V3 343 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 NXPE1Q8N323 547 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SCAMP4Q969E2 229 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PGM2Q96G03 612 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC17A9Q9BYT1 436 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PRR23AA6NEV1 266 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM47DPA6NHR8 397 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 F8W8V4 182 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 K7ESF4 209 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 LAMTOR5O43504 91 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ACRV1P26436 265 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PTGER3P43115 390 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR1P46091 355 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 POLD2P49005 469 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 DNAJC3Q13217 504 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 LRRC14Q15048 493 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 HSP90B2PQ58FF3 399 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RAET1GQ6H3X3 334 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC36A4Q6YBV0 504 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 TPSD1Q9BZJ3 242 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PSAT1Q9Y617 370 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA8CPA6NN73 597 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 CFAP99D6REC4 459 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PI15O43692 258 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 TECTAO75443 2155 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PIAS1O75925 651 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 S1PR4O95977 384 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RALBP11234 206 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ADARP55265 1226 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 TMED2Q15363 201 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 LDLRAP1Q5SW96 308 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 RFLNAQ6ZTI6 216 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SERPINA9Q86WD7 417 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 COPS8Q99627 209 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 EURLQ9NYK6 297 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC17A6Q9P2U8 582 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa23.39■■□□□ 1.34
TSPAN4-202ENST00000397396 AGPSO00116 658 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 NDUFS2O75306 463 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 AHSGP02765 367 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 ITGA2BP08514 1039 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 MPP1Q00013 466 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 SEMA3AQ14563 771 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 KIAA0895LQ68EN5 471 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 PIANPQ8IYJ0 282 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 BTN2A2Q8WVV5 523 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 GLYATL1Q969I3 302 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 VPS39Q96JC1 886 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 SH3GL2Q99962 352 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 TMBIM4Q9HC24 238 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 MED4Q9NPJ6 270 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 CD93Q9NPY3 652 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 SENP1Q9P0U3 644 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 DMTF1Q9Y222 760 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 H3BMM5 538 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 QSOX1O00391 747 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 LATO43561 262 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 UGT1A9O60656 530 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPAN4-202ENST00000397396 KRT15P19012 456 aa23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms