RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368671.3

CLRN3-201, Transcript of clarin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN3, Length 1,152 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN3-201ENST00000368671 OCIAD1Q9NX40 245 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 IP6K2Q9UHH9 426 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 CHKBQ9Y259 395 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CLRN3-201ENST00000368671 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 A0A0J9YYE9 177 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CYSRT1A8MQ03 144 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ARHGAP6O43182 974 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 RAD1O60671 282 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 EML2O95834 649 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SERPINC1P01008 464 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TRBC1P01850 177 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF30P17039 623 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 UGT1A3P35503 534 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 MAPK9P45984 424 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CSRP3P50461 194 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 GPLD1P80108 840 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 LINC01559Q495D7 138 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CCDC122Q5T0U0 273 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DCAF12Q5T6F0 453 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ANKS6Q68DC2 871 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM71Q6P5X7 295 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF765Q7L2R6 523 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TEX26Q8N6G2 289 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 OR10G6Q8NH81 332 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 EXD1Q8NHP7 514 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 LRRN4Q8WUT4 740 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NUP85Q9BW27 656 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DDA1Q9BW61 102 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SLC12A9Q9BXP2 914 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 IL17BQ9UHF5 180 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 A0A1B0GTH6 734 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SUV39H1O43463 412 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DUX1O43812 170 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CLDN7O95471 211 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 PYGLP06737 847 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 IL4RP24394 825 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 FASLGP48023 281 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ZNF165P49910 485 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 STC1P52823 247 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 HHEXQ03014 270 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 GALNT2Q10471 571 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NFATC2Q13469 925 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SQSTM1Q13501 440 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 LRP8Q14114 963 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 IHHQ14623 411 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NFKBIBQ15653 356 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 HADHQ16836 314 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 BORAQ6PGQ7 559 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CYP4X1Q8N118 509 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SFRP1Q8N474 314 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 MAML1Q92585 1016 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 COX14Q96I36 57 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CTRCQ99895 268 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DNPEPQ9ULA0 475 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 KCNK6Q9Y257 313 aa10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 MGAQ8IWI9 3026 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 B4E171 279 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 MYO1FO00160 1098 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 MATN3O15232 486 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SIAH2O43255 324 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 SNX2O60749 519 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DNAJC6O75061 913 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 HLA-DQB2P05538 268 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 ACP5P13686 325 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 CA4P22748 312 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 TSPAN7P41732 249 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 POLE2P56282 527 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 RAB15P59190 212 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 NIPAL4Q0D2K0 466 aa10.25□□□□□ -0.77
CLRN3-201ENST00000368671 DPYSL3Q14195 570 aa10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms