RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 XIAPP98170 497 aa29.4■■■□□ 2.3
ECHS1-201ENST00000368547 PEX6Q13608 980 aa29.4■■■□□ 2.3
ECHS1-201ENST00000368547 RASA2Q15283 850 aa29.4■■■□□ 2.3
ECHS1-201ENST00000368547 KLHL38Q2WGJ6 581 aa29.4■■■□□ 2.3
ECHS1-201ENST00000368547 TDRPQ86YL5 185 aa29.4■■■□□ 2.3
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ECHS1-201ENST00000368547 ARL8AQ96BM9 186 aa29.4■■■□□ 2.3
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ECHS1-201ENST00000368547 NLRP8Q86W28 1048 aa29.39■■■□□ 2.3
ECHS1-201ENST00000368547 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
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ECHS1-201ENST00000368547 TMEM145Q8NBT3 493 aa29.37■■■□□ 2.29
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ECHS1-201ENST00000368547 LGALS13Q9UHV8 139 aa29.37■■■□□ 2.29
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF398Q8TD17 642 aa29.36■■■□□ 2.29
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ECHS1-201ENST00000368547 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa29.36■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 USP34Q70CQ2 3546 aa29.36■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 POM121BA6NF01 834 aa29.35■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 H0Y8X5 98 aa29.35■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 GOLGA8TH3BQL2 631 aa29.35■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 UGT1A9O60656 530 aa29.35■■■□□ 2.29
ECHS1-201ENST00000368547 UGT1A6P19224 532 aa29.35■■■□□ 2.29
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