RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 RGS18Q9NS28 235 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 OBP2AQ9NY56 170 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FZD10Q9ULW2 581 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF292O60281 2723 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF318Q5VUA4 2279 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAM186AA6NE01 2351 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CXorf65A6NEN9 183 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 POM121BA6NF01 834 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SMTNL1A8MU46 457 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAM86B1E9PN63 330 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LINC01565O15544 149 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LDB3O75112 727 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FGF18O76093 207 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 REC8O95072 547 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CSPG5O95196 566 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CCNE2O96020 404 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GLUD1P00367 558 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ITGA5P08648 1049 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAM86B2P0C5J1 330 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00271P0C7V0 271 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA6DP0CG33 693 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 IDEP14735 1019 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SFNP31947 248 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 PPM1AP35813 382 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 NRIP1P48552 1158 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GLUD2P49448 558 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 POLE2P56282 527 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SHC2P98077 582 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 COASYQ13057 564 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CAMK1Q14012 370 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM266Q2M3C6 531 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GFOD2Q3B7J2 385 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FBXL16Q8N461 479 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 KDM1BQ8NB78 822 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 RSPH1Q8WYR4 309 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB10Q96DT7 871 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TCEANC2Q96MN5 208 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM117Q9H0C3 514 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SH3GLB2Q9NR46 395 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM161AQ9NX61 479 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DACT1Q9NYF0 836 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LZTS1Q9Y250 596 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DTX4Q9Y2E6 619 aa5□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TECTAO75443 2155 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 I6L893 689 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CPLX1O14810 134 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 NKX2-8O15522 239 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TBX10O75333 385 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 C22orf31O95567 290 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 VTNP04004 478 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 IFNAR1P17181 557 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DNAJB1P25685 340 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CLCN3P51790 818 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 NLRP5P59047 1200 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DSC1Q08554 894 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 MAPKAPK3Q16644 382 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 XKR3Q5GH77 459 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 GALNT17Q6IS24 598 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAM228AQ86W67 206 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 LRRC43Q8N309 656 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 RDM1Q8NG50 284 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CRYGNQ8WXF5 182 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 FAR2Q96K12 515 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF558Q96NG5 402 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRC-204ENST00000367379 RIT2Q99578 217 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms