RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355396.7

SUSD1-201, Transcript of sushi domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SUSD1, Length 2,861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1-201ENST00000355396 SEPT6Q14141 434 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PTPRCAPQ14761 206 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 BBS9Q3SYG4 887 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 GPR33Q49SQ1 333 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SPANXN3Q5MJ09 141 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PELI3Q8N2H9 469 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 MFSD2AQ8NA29 543 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SCAMP4Q969E2 229 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PROB1E7EW31 1015 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FPGTO14772 594 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SLC31A1O15431 190 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 POLBP06746 335 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 KIAA1024LP59773 190 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 KYNUQ16719 465 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 LAIR1Q6GTX8 287 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SYT12Q8IV01 421 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 GPR150Q8NGU9 434 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 KLK6Q92876 244 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 TLCD1Q96CP7 247 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 MFSD3Q96ES6 412 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 TM9SF3Q9HD45 589 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SUSD2Q9UGT4 822 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 R4GN57 208 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 VGLL3A8MV65 326 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FADS2P1A8MWK0 482 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 BANF1O75531 89 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ACSL3O95573 720 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FOXN2P32314 431 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ITGA9Q13797 1035 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 KRT71Q3SY84 523 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SNX20Q7Z614 316 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SERAC1Q96JX3 654 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 TBATAQ96M53 351 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 AGAP2Q99490 1192 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.5□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SPAG17Q6Q759 2223 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 A6NNZ2 444 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 VILLO15195 856 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ITPKAP23677 461 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 RABIFP47224 123 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 NFATC2Q13469 925 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CRYMQ14894 314 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 DEFB119Q8N690 84 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 MOCS1Q9NZB8 636 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CD84Q9UIB8 345 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 A0A1B0GTW7 788 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 POM121BA6NF01 834 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 K7ESM1 405 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 WNT1P04628 370 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PAMP19021 973 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CD38P28907 300 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 MAGEA4P43358 317 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CACNG1Q06432 222 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 IFFO1Q0D2I5 559 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 INPP5AQ14642 412 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CHRNA6Q15825 494 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PLA2G2CQ5R387 149 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 CEP76Q8TAP6 659 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ZNF398Q8TD17 642 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 HDAC10Q969S8 669 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ULK4Q96C45 1275 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 PGM2Q96G03 612 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 C9orf72Q96LT7 481 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SLC6A18Q96N87 628 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 APOOQ9BUR5 198 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.49□□□□□ -0.57
SUSD1-201ENST00000355396 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms