RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A1P22309 533 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A4P22310 534 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A3P35503 534 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 UGT1A5P35504 534 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 RUNX3Q13761 415 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GRM2Q14416 872 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CHRNA6Q15825 494 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 YAF2Q8IY57 180 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CPA6Q8N4T0 437 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 KCNJ9Q92806 393 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PBXIP1Q96AQ6 731 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PNPOQ9NVS9 261 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GALPQ9UBC7 116 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SLC12A4Q9UP95 1085 aa19.06■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SCN8AQ9UQD0 1980 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NEMP2A6NFY4 417 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NIPSNAP2O75323 286 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CHRM3P20309 590 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CA5AP35218 305 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SCTRP47872 440 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 KCNC1P48547 511 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 DNAJB13P59910 316 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GPR33Q49SQ1 333 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF805Q5CZA5 627 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PTERQ96BW5 349 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CCDC126Q96EE4 140 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 POMKQ9H5K3 350 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ACSS2Q9NR19 701 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GTSE1Q9NYZ3 720 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 DOCK8Q8NF50 2099 aa19.05■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TSPAN11A1L157 253 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PSMC3P17980 439 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SERPINB3P29508 390 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 BNIP1Q12981 228 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 RCN2Q14257 317 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 KDM1BQ8NB78 822 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 WWP1Q9H0M0 922 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CRLS1Q9UJA2 301 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GOLGA8CPA6NN73 597 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 E5RI56 91 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 H3BMM5 538 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 IPO13O94829 963 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 C1SP09871 688 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 LAMP2P13473 410 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TIMP2P16035 220 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 KCNA5P22460 613 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ACRV1P26436 265 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ARHGEF7Q14155 803 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TTC7BQ86TV6 843 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 RBFAQ8N0V3 343 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PHTF2Q8N3S3 785 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF781Q8N8C0 355 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TERB1Q8NA31 727 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 RHEBL1Q8TAI7 183 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 HCAR2Q8TDS4 363 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SLC30A3Q99726 388 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 KXD1Q9BQD3 176 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 DERL2Q9GZP9 239 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CLPBQ9H078 707 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF576Q9H609 170 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 DKK3Q9UBP4 350 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NUMBLQ9Y6R0 609 aa19.04■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TBC1D3BA6NDS4 549 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 A8MT66 165 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 AGAP14A8MT82 685 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 UPK3BL1B0FP48 263 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 UPK3BL2E5RIL1 263 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 F8W8V4 182 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 CHRNGP07510 517 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZNF30P17039 623 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 NFKBIAP25963 317 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 GJA4P35212 333 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 OPRD1P41143 372 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 SPINT3P49223 89 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 ZBTB16Q05516 673 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 PARM1Q6UWI2 310 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 TRIM67Q6ZTA4 783 aa19.03■□□□□ 0.64
UPP1-201ENST00000331803 RFLNAQ6ZTI6 216 aa19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms