RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 KIAA1191Q96A73 305 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PHF21BQ96EK2 531 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SCRN2Q96FV2 425 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TAGLN3Q9UI15 199 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 MSRAQ9UJ68 235 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 FBXO10Q9UK96 956 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 STK38LQ9Y2H1 464 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 WASH3PC4AMC7 463 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 CYP17A1P05093 508 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TPBGLP0DKB5 382 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 BPIP17213 487 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 AOC1P19801 751 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 ITGALP20701 1170 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SP100P23497 879 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 GRAMD4Q6IC98 578 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TPRG1Q6ZUI0 275 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 FRMD7Q6ZUT3 714 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 KDM1BQ8NB78 822 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 ATOH8Q96SQ7 321 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 BTBD10Q9BSF8 475 aa26.65■■□□□ 1.86
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HOXD8-201ENST00000313173 A0A1W2PQ67 120 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM24O15164 1050 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SPAM1P38567 509 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 NRIP1P48552 1158 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 ARHGAP8P85298 464 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 CRTC1Q6UUV9 634 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN33Q86UF1 283 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 RSPRY1Q96DX4 576 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TRMOQ9BU70 441 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 SFXN1Q9H9B4 322 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 GALPQ9UBC7 116 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD8-201ENST00000313173 TRANK1O15050 2925 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 KERAO60938 352 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 UGT2B4P06133 528 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 NFATC2Q13469 925 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GEN1Q17RS7 908 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 METTL21CQ5VZV1 264 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 OR2A12Q8NGT7 310 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CD200R1Q8TD46 325 aa26.63■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 SLC30A3Q99726 388 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 LMAN2LQ9H0V9 348 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ASB8Q9H765 288 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 TCF7L2Q9NQB0 619 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ADH5P11766 374 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 ZNF678Q5SXM1 525 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 STAG3L4Q8TBR4 150 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 EXT2Q93063 718 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 MIPEPQ99797 713 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GSTO2Q9H4Y5 243 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 E5RI56 91 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 HERVK_113P63132 956 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 RIPK1Q13546 671 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 EML3Q32P44 896 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa26.62■■□□□ 1.85
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HOXD8-201ENST00000313173 RINLQ6ZS11 566 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 LONP2Q86WA8 852 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 OR52B2Q96RD2 323 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ERVK-6Q9BXR3 956 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GTSE1Q9NYZ3 720 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 C2orf16Q68DN1 1984 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 ADH1CP00326 375 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 MTHFD2P13995 350 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 CHRM3P20309 590 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD8-201ENST00000313173 LRRC66Q68CR7 880 aa26.61■■□□□ 1.85
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