RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 E9PAM4 449 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ELFN1P0C7U0 828 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4B1P13584 511 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ICAM3P32942 547 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MTHFRP42898 656 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 APOLD1Q96LR9 279 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FGBP02675 491 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNGP07510 517 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CTSKP43235 329 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC157Q569K6 752 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF567Q8N184 647 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FAM81AQ8TBF8 368 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQ67 120 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 WWP2O00308 870 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PRKAR1AP10644 381 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RHAGQ02094 409 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FLCNQ8NFG4 579 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MFSD3Q96ES6 412 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.05■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DNM1LO00429 736 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PLK4O00444 970 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CHPFQ8IZ52 775 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 COX4I2Q96KJ9 171 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SPACA7Q96KW9 195 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 COMMD9Q9P000 198 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TRIM17Q9Y577 477 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ELOVL7A1L3X0 281 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC162PA2VCL2 907 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C2CD4BA6NLJ0 364 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HTR1BP28222 390 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ROPN1LQ96C74 230 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ING4Q9UNL4 249 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC14BA6NHZ5 514 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 H0Y858 1186 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MMP3P08254 477 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNB2P17787 502 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ACLYP53396 1101 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 DGKZQ13574 1117 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 C17orf64Q86WR6 236 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SGK2Q9HBY8 427 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RAB23Q9ULC3 237 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ISM1B1AKI9 464 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 MATN3O15232 486 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GNRH1P01148 92 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HNMTP50135 292 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG1Q06432 222 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FSTL1Q12841 308 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ALG11Q2TAA5 492 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LBX2Q6XYB7 198 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BANPQ8N9N5 519 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 HM13Q8TCT9 377 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ABCG8Q9H221 673 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 EXD2Q9NVH0 621 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 U3KQV3 271 aa21.04■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SSNA1O43805 119 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 IGFBP5P24593 272 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OR1D2P34982 312 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 LIPEQ05469 1076 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CCNIQ14094 377 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP52Q8N1V2 620 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 GPR21Q99679 349 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 SEMA3GQ9NS98 782 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 ACSL4O60488 711 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CD48P09326 243 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 CLCQ05315 142 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 VPS26BQ4G0F5 336 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 PGRMC2O15173 223 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 UROSP10746 265 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 THRBP10828 461 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BNC1Q01954 994 aa21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
CCSAP-201ENST00000284617 BLMHQ13867 455 aa21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms