RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A1P02730 911 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEC24CP53992 1094 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.26■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 LYSMD1Q96S90 227 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17CQ9P0M4 197 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLLPQ9Y342 182 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKP3Q9Y446 797 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AREL1O15033 823 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPR37L1O60883 481 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HAUS5O94927 633 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LHCGRP22888 699 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ETV4P43268 484 aa20.25■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP6Q96FZ7 201 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM111AQ96PZ2 611 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEMP1O14524 444 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S1PR4O95977 384 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHRS4L1P0CG22 281 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MMP12P39900 470 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADPRHP54922 357 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERAP2Q6P179 960 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.24■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSTA1P08263 222 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RALGDSQ12967 914 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDKN3Q16667 212 aa20.23■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KBTBD6Q86V97 674 aa20.23■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS11Q9H270 941 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FZD4Q9ULV1 537 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNA1HO95180 2353 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A096LPK6 155 aa20.22■□□□□ 0.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
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