RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS11Q9H270 941 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ASB8Q9H765 288 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 DYRK4Q9NR20 520 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 DCDC2Q9UHG0 476 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PLLPQ9Y342 182 aa24.78■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP14A8MT82 685 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 AREL1O15033 823 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 PFDN6O15212 129 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR39O43194 453 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 GLRA3O75311 464 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFS3O75489 264 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ADRB3P13945 408 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 STMN1P16949 149 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ITGALP20701 1170 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SAT1P21673 171 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SATB1Q01826 763 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TFF2Q03403 129 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNA6Q15825 494 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC44A4Q53GD3 710 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 SDE2Q6IQ49 451 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 CERS6Q6ZMG9 384 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R42Q7RTR8 314 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ERLEC1Q96DZ1 483 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 OLFM1Q99784 485 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 VWA7Q9Y334 891 aa24.77■■□□□ 1.56
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM23O75077 832 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CRABP2P29373 138 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV4P43268 484 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ELP6Q0PNE2 266 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 INSCQ1MX18 579 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR33Q49SQ1 333 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM45BPQ6NSW5 357 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LVRNQ6Q4G3 990 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPIQ6XZB0 460 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC14AQ86T13 490 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF398Q8TD17 642 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ITM2BQ9Y287 266 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RGSL1A5PLK6 1076 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 H0Y858 1186 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PLK4O00444 970 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35E2BP0CK96 405 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 LSP1P33241 339 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CA5AP35218 305 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CST6Q15828 149 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RAPH1Q70E73 1250 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM3CQ92520 227 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM111AQ96PZ2 611 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC134Q9H6E4 229 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD18Q9NS91 495 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TLK1Q9UKI8 766 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GRID1Q9ULK0 1009 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.76■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 F5P12259 2224 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMD11O00231 422 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH1BP00325 375 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GSTA1P08263 222 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS4L1P0CG22 281 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A6P19224 532 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A1P22309 533 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A4P22310 534 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A3P35503 534 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 UGT1A5P35504 534 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GMPRP36959 345 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY2P41231 377 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PTGER3P43115 390 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 PGGT1BP53609 377 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 COPAP53621 1224 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC12A2P55011 1212 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 ADARP55265 1226 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DCDC1P59894 354 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1211LQ6NV74 962 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINA9Q86WD7 417 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2T3Q8NH03 318 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 GDAP1Q8TB36 358 aa24.75■■□□□ 1.55
CAPNS1-215ENST00000628018 DTX3LQ8TDB6 740 aa24.75■■□□□ 1.55
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