RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP8	P85298	464 aa		24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	NETO1	Q8TDF5	533 aa		24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		24.8	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229		H3BM21	787 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	SCAMP1	O15126	338 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ASMTL	O95671	621 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	SOD1	P00441	154 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM23	P36406	574 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	CDK16	Q00536	496 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	HID1	Q8IV36	788 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	HIC2	Q96JB3	615 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TEX101	Q9BY14	249 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		24.79	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GTQ1	180 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	HEATR9	A2RTY3	570 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM202	A6NGA9	273 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	AP3B1	O00203	1094 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	CCL22	O00626	93 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PPFIA2	O75334	1257 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM63A	O94886	807 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	JUND	P17535	347 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TEAD1	P28347	426 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PPARD	Q03181	441 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TCEA2	Q15560	299 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	GDAP1	Q8TB36	358 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	BFAR	Q9NZS9	450 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		24.78	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF292	O60281	2723 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	YKT6	O15498	198 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	LDB2	O43679	373 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	MGAT1	P26572	445 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	HADHA	P40939	763 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	CRADD	P78560	199 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PCGF5	Q86SE9	256 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	NLRP8	Q86W28	1048 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	RBFA	Q8N0V3	343 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	PDXP	Q96GD0	296 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	IL26	Q9NPH9	171 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	24.77	■■□□□ 1.56
GPS1-223	ENST00000584229	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	RAD51C	O43502	376 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	PRAMEF1	O95521	474 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	BNIP3	Q12983	259 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	LAMB3	Q13751	1172 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ITGA9	Q13797	1035 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	TUBB2A	Q13885	445 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CHRNA6	Q15825	494 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ALG11	Q2TAA5	492 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CASC4	Q6P4E1	433 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF534	Q76KX8	674 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	FGF22	Q9HCT0	170 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	24.76	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	GPR39	O43194	453 aa		24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	RASGRP1	O95267	797 aa		24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CSF2	P04141	144 aa		24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	CTSE	P14091	401 aa		24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	24.75	■■□□□ 1.55
GPS1-223	ENST00000584229	ADRA1D	P25100	572 aa		24.75	■■□□□ 1.55

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