RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582772.1

MSI2-216, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 398 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-216	ENST00000582772	CASP9	P55211	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ARG2	P78540	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	VLDLR	P98155	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	5e-6	■■□□□ 13.7
MSI2-216	ENST00000582772	TUBB3	Q13509	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AGER	Q15109	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RABEP1	Q15276	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FUK	Q8N0W3	1084 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LGI4	Q8N135	537 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SFRP1	Q8N474	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RNF34	Q969K3	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OLFM1	Q99784	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PANK2	Q9BZ23	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772		A0A096LNT2	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRC1	O43663	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ASNA1	O43681	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	AP1G2	O75843	785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	BEST1	O76090	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	WDPCP	O95876	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SERPINC1	P01008	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SCP2	P22307	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IGFBP5	P24593	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SOX11	P35716	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GFER	P55789	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MTM1	Q13496	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	VEZF1	Q14119	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LRRC14	Q15048	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RTN1	Q16799	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SH3GL2	Q99962	352 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IL25	Q9H293	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRSS38	A1L453	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SLC26A4	O43511	780 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	MED24	O75448	989 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LEFTY1	O75610	366 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SCRG1	O75711	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KLHL18	O94889	574 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	HNF1A	P20823	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	SEPHS1	P49903	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	LIG4	P49917	911 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	KIF11	P52732	1056 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	RBP5	P82980	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	PMP22	Q01453	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSI2-216	ENST00000582772	ACY1	Q03154	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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