RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	USP7	Q93009	1102 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MED8	Q96G25	268 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RMI1	Q9H9A7	625 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RDH14	Q9HBH5	336 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	VPS18	Q9P253	973 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LAMA5	O15230	3695 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LRRD1	A4D1F6	860 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF487	B1APH4	448 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	B4GAT1	O43505	415 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PRAMEF10	O60809	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SFTPC	P11686	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ITIH1	P19827	911 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KDELR1	P24390	212 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ARSE	P51690	589 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	STC1	P52823	247 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MESD	Q14696	234 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SGF29	Q96ES7	293 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TAAR9	Q96RI9	348 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	STMND1	H3BQB6	276 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	AGRP	O00253	132 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	INPP4B	O15327	924 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	DUX1	O43812	170 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	C1QL1	O75973	258 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	MAP3K6	O95382	1288 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CLDN7	O95471	211 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	JCHAIN	P01591	159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FUCA1	P04066	466 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ITGB2	P05107	769 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CD1C	P29017	333 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LIMK2	P53671	638 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	AP1B1	Q10567	949 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PDK1	Q15118	436 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	VSIG1	Q86XK7	387 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	NAGS	Q8N159	534 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TTC9	Q92623	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FAF2	Q96CS3	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC42	Q96M95	316 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RNF157	Q96PX1	679 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LYSMD1	Q96S90	227 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	IGHV5-10-1	A0A0J9YXX1	117 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	OR5K4	A6NMS3	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743		B8ZZF3	427 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	APOL1	O14791	398 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PPM1D	O15297	605 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PLA2G2A	P14555	144 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CD86	P42081	329 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	FASLG	P48023	281 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	SPINT3	P49223	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	RAB15	P59190	212 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	GBE1	Q04446	702 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	LY6D	Q14210	128 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-208	ENST00000579743	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23

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