RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559494.1

TSPAN3-207, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PIP4P1Q86T03 277 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 RBFAQ8N0V3 343 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC25A45Q8N413 288 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 OR56A4Q8NGH8 313 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 OR1E3Q8WZA6 343 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 COX14Q96I36 57 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 RTKNQ9BST9 563 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SPATA16Q9BXB7 569 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 FGF22Q9HCT0 170 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 IL26Q9NPH9 171 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.17■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 INPP4BO15327 924 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PIAS2O75928 621 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 ECEL1O95672 775 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CRTAMO95727 393 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 FUCA1P04066 466 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CEACAM5P06731 702 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 DGKAP23743 735 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TERF1P54274 439 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 POU6F1Q14863 301 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CERCAMQ5T4B2 595 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TRIM74Q86UV6 250 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 HID1Q8IV36 788 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TRAM1L1Q8N609 369 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SLCO2A1Q92959 643 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 HIC2Q96JB3 615 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 KLQ9UEF7 1012 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PKP3Q9Y446 797 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 DCHS1Q96JQ0 3298 aa20.16■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 MYLKQ15746 1914 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CCDC188H7C350 402 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TNFRSF10CO14798 259 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PPFIA2O75334 1257 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 GAS8O95995 478 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TPSB2P20231 275 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 KELP23276 732 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 MAGEA6P43360 314 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 POLD2P49005 469 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 HK3P52790 923 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 KCNJ11Q14654 390 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 TPSAB1Q15661 275 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 OR13C4Q8NGS5 318 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 CPT1BQ92523 772 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 PDXPQ96GD0 296 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 SPTBN2O15020 2390 aa20.15■□□□□ 0.82
TSPAN3-207ENST00000559494 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 SCAMP1O15126 338 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 RASGRP1O95267 797 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 CA5AP35218 305 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 SPAM1P38567 509 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 CDK16Q00536 496 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 PDE1BQ01064 536 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 C1orf61Q13536 156 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 PPP1R7Q15435 360 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 CHRNA6Q15825 494 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 ANKRD22Q5VYY1 191 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 NAXDQ8IW45 347 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 DGKBQ9Y6T7 804 aa20.14■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 LRP4O75096 1905 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 MROH6A6NGR9 719 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 H3BM21 787 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 FLRT2O43155 660 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A9O60656 530 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 CBFA2T3O75081 653 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 TNFP01375 233 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 GIMD1P0DJR0 217 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A6P19224 532 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A1P22309 533 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A4P22310 534 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A3P35503 534 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 UGT1A5P35504 534 aa20.13■□□□□ 0.81
TSPAN3-207ENST00000559494 TMPRSS15P98073 1019 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms