RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558285.5

USP3-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3, Length 1,742 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-208ENST00000558285 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 A8MX80 341 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 MAP3K7O43318 606 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TCEA3O75764 348 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ASMTLO95671 621 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PRKCGP05129 697 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 FGF1P05230 155 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PROS1P07225 676 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ETV3P41162 512 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 STC1P52823 247 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 SKOR1P84550 965 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CDK3Q00526 305 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 LAMB3Q13751 1172 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GTF2H3Q13889 308 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PCSK7Q16549 785 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TRIM58Q8NG06 486 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TTC25Q96NG3 672 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 FCRL5Q96RD9 977 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 VIPAS39Q9H9C1 493 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 VPS18Q9P253 973 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GPR34Q9UPC5 381 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PLXNA2O75051 1894 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PRSS38A1L453 326 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CPED1A4D0V7 1026 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 C2orf81A6NN90 581 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 F8W8V4 182 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TRIM38O00635 465 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PMPCBO75439 489 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 DKK1O94907 266 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 RBP3P10745 1247 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ITIH2P19823 946 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PTPN3P26045 913 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 MNAT1P51948 309 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 DCDC1P59894 354 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ZBTB17Q13105 803 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 NOMO1Q15155 1222 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 RPS6KA1Q15418 735 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ST3GAL2Q16842 350 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ALG11Q2TAA5 492 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 DHRS13Q6UX07 377 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 Q6ZVL8 140 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 SLCO6A1Q86UG4 719 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 LRRC61Q9BV99 259 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 STRADBQ9C0K7 418 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GULP1Q9UBP9 304 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 RAB21Q9UL25 225 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PADI4Q9UM07 663 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GUCA1BQ9UMX6 200 aa8.63□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 AP3B1O00203 1094 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 KCNN4O15554 427 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CRTAMO95727 393 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 NEFHP12036 1026 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 PNLIPP16233 465 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 SPINT3P49223 89 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ITGA9Q13797 1035 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CRYMQ14894 314 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 QPCTQ16769 361 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 HES3Q5TGS1 186 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 NPNTQ6UXI9 565 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 C4orf22Q6V702 233 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 ZNF662Q6ZS27 426 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 LINC00523Q86TU6 105 aa8.62□□□□□ -1.03
USP3-208ENST00000558285 CPNE8Q86YQ8 564 aa8.62□□□□□ -1.03
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