RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556274.5

ATXN3-237, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 913 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-237ENST00000556274 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 TERB1Q8NA31 727 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FAM172AQ8WUF8 416 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 RLN3Q8WXF3 142 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 IGSF8Q969P0 613 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 AZIN2Q96A70 460 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 IQCDQ96DY2 449 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 SLC39A13Q96H72 371 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CCDC42Q96M95 316 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 NPY6RQ99463 290 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CHP1Q99653 195 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 KCNH6Q9H252 994 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ZWILCHQ9H900 591 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PCDH12Q9NPG4 1184 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 C14orf119Q9NWQ9 140 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 SUN2Q9UH99 717 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 GGA2Q9UJY4 613 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 STON1Q9Y6Q2 735 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 VCANP13611 3396 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 A0A087X0T9 212 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FAM47DPA6NHR8 397 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 E9PAM4 449 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 AP5Z1O43299 807 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CCP110O43303 1012 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PRPSAP2O60256 369 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CDC14BO60729 498 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CNTN5O94779 1100 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FSBPO95073 299 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LATS1O95835 1130 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PENKP01210 267 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 IGLV3-27P01718 113 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 RHOCP08134 193 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CELA3BP08861 270 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 H2AFZP0C0S5 128 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FAM228BP0C875 321 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 GZMAP12544 262 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CR2P20023 1033 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 HLA-FP30511 346 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ADRA1BP35368 520 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PBX1P40424 430 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CSKP41240 450 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PRKCIP41743 596 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ZNF75DP51815 510 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 GALCP54803 685 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LGALS4P56470 323 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 KRT83P78385 493 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ECT2LQ008S8 904 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LMAN2Q12907 356 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 MAMLD1Q13495 774 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ZNF234Q14588 700 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 E2F5Q15329 346 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CCDC6Q16204 474 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FSCBQ5H9T9 825 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 BRMS1LQ5PSV4 323 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 TRNP1Q6NT89 227 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 H2AFVQ71UI9 128 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 MON1BQ7L1V2 547 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 BEND5Q7L4P6 421 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 SYT13Q7L8C5 426 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CLEC14AQ86T13 490 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LONP2Q86WA8 852 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 DCLK2Q8N568 766 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 CCDC185Q8N715 623 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FRMD1Q8N878 549 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 C3orf20Q8ND61 904 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-237ENST00000556274 FIBINQ8TAL6 211 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms